Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf44Q3UHJ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms