Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbxip1Q3TVI8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms