Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim7Q3TJD7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms