Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp39Q3TIX9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms