Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXA2

Vmn1r11, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r11Q3SXA2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r11Q3SXA2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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