Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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