Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd11Q1RNF8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms