Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Rpusd3Q14AI6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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