Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rab42Q0PD08 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms