Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn2Q08093 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn2Q08093 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms