Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms