Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gdf3Q07104 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gdf3Q07104 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms