Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcst1Q059Y8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcst1Q059Y8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms