Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms