Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms