Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp1Q00915 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms