Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms