Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cited1P97769 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms