Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3aP97351 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms