Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms