Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nucb2P81117 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nucb2P81117 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms