Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms