Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crnkl1P63154 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms