Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cldn18P56857 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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