Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms