Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptx3P48759 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptx3P48759 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptx3P48759 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptx3P48759 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptx3P48759 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptx3P48759 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptx3P48759 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptx3P48759 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptx3P48759 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptx3P48759 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptx3P48759 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptx3P48759 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms