Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms