Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab17P35292 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab17P35292 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms