Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms