Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna1P26231 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms