Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms