Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria1P23818 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms