Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Edn1P22387 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms