Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms