Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18530 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18530 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P18530 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P18530 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P18530 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms