Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18528 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18528 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18528 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18528 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms