Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms