Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp2P11378 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp2P11378 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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