Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms