Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtaP09225 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtaP09225 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtaP09225 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtaP09225 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtaP09225 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtaP09225 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtaP09225 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtaP09225 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtaP09225 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtaP09225 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtaP09225 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtaP09225 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtaP09225 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtaP09225 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtaP09225 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtaP09225 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtaP09225 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtaP09225 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtaP09225 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtaP09225 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtaP09225 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtaP09225 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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