Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms