Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna4P07351 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms