Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P06323 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P06323 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P06323 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P06323 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P06323 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P06323 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
P06323 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P06323 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P06323 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06323 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06323 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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