Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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