Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psma3O70435 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma3O70435 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms