Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lnx1O70263 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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