Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgceO70258 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgceO70258 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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