Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1bO70237 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1bO70237 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1bO70237 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1bO70237 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1bO70237 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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