Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms