Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sypl1O09117 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms